北京茅以升科技教育基金會理事會是基金會的法人代表機構和領導管理機構,其職權為決定資金的募集、管理和使用,審定年度收支預算和決算,制定和檢查年度工作計劃,決定相關機構的人事任免,審議工作報告,決定機構設置、制度制定及其它重大事項。

      第三屆北京茅以升科技教育基金會理事會理事長為第九、十、十一屆全國政協委員、北京茅以升科技教育基金會原理事長茅玉麟;副理事長為中國鐵路總公司總工程師鄭健,中國鐵道科學研究院集團有限公司黨委書記、董事長,中國國家鐵路集團有限公司科信部主任周黎,中國土木工程學會秘書長李明安;秘書長為中國鐵道科學研究院集團有限公司鐵建所原黨委書記劉曉光;理事為中國科協科普部部長白希,中國鐵建股份有限公司科技創新班總經理許和平,中鐵二院工程集團有限責任公司黨委書記、董事長張敏,中國中鐵股份有限公司總工程師孔遁,中鐵大橋勘測設計院集團有限公司總經理、黨委副書記田道明,九三學社中央原副秘書長兼參政議政部部長趙勇,北京交通大學黨委常委、副校長關忠良,西南交通大學黨委常委、副校長蒲云,中國人壽保險股份有限公司科技園區總經理車安蘭,北京茅以升科技教育基金會副秘書長茅為中,愛倫,共有十六人。